| 1. | Феодосий (Бывальцев) | 1461-1464 — оставил кафедру из-за конфликта с духовенством, умер в 1475 году в Чудовом монастыре | Василий II Тёмный, 1425-1462 |
| 2. | Филипп I | 1464 - ум. 18 апреля 1473 | |
| 3. | Геро́нтий | с 29 июня 1473 - 1489гг. | |
| 4. | Прохор | 1489-1490 — в/у еп. Сарский и Подонский | Иван III Васильевич, 1462-1505 |
| 5. | Зосима (Брадатый) | 1490-1494 — оставил кафедру, умер не ранее 1496 года в Троице-Сергиевом монастыре | |
| 6. | Свт. Симон (Чиж) | (1495— 1511 гг.) | |
| 7. | Варлаам | 1511-1521 — смещён с митрополии великим князем и сослан в Каменный монастырь на Кубенское озеро, где умер в 1533 году | Василий III Иванович, 1505-1533 |
| 8. | Даниил | 1522-1539 — смещен Шуйскими, умер в 1547 году в Иосифо-Волоколамском монастыре | |
| 9. | Иоасаф (Скрипицын) | 1539-1542 — смещен Шуйскими, умер в 1555 году в Троице-Сергиевом монастыре | |
| 11. | Афанасий | 1564-1566 — отказался от кафедры «За немощью великою» хотя возможно из-за введения опричнины умер в 1570 году в Чудовом монастыре | |
| 12. | Герман | архиеп. Казанский и Свияжский наречен в июле 1566 в митрополиты, но из-за обличения опричнины смещен царем и убит в 1567 году | Иван IV Грозный, 1533-1584 |
| 13. | Св.муч. Филипп II (Колычёв) | 1566-1568 — из-за обличения опричнины смещен царем и убит в 1569 году Малютой Скуратовым | |
| 14. | Кирилл | 1568 - 1572 гг. | |
| 15. | Антоний | 1572 - 1581 гг. | |
| 16. | Дионисий | 1581-1586 — из-за обличения царского шурина Бориса Годунова смещен и сослан в Хутынский монастырь, где умер в 1587 году | |
| 17. | Свт. Иов | 1586-1589 — возведен в сан патриарха | Фёдор I Иоаннович, 1584-1598 |
| | | |
